قال المفكر الاسلامى كمال حبيب أن التيار الجهادى فى سيناء كان يشكل عبئا على الاخوان أثناء فترة وجودهم فى السلطة حيث لم تتفهم وجود رئيس اسلامى على رأس السلطة وكانت تعارضه. وأضاف أن محاولات الإخوان لاحتواء وتهدئة هذه التيارات لم تنجح بسبب تعنت بعض الوسطاء نافيا بشدة ان يكون هناك تواصل وتحالف بين الاخوان وبين التيارات الجهادية.